病毒感染：如孕妇上呼吸道感染、风疹等。
药物作用：如服用抗癫痫药、类胆固醇、抗过敏、抗癌药物等。
内分泌：精神性或损伤性的因素，如遭到强烈的精神刺激、身体外部遭损伤等。
营养因素：早孕期的呕吐，厌食，偏食等导致维生素D、叶酸、铁、钙等的缺乏。
其他因素：如照射X线、吸烟、酗酒、缺氧。另外，唇腭裂有相当部分是遗传的，一般唇腭裂发生在第一胎的概率为1/600，如果第一胎是唇腭裂的在第二胎发生唇腭裂的几率为3/100。
专家说，严重的兔唇患儿会影响到吃奶，不能正常哺乳，会导致患儿营养不良。患儿在生长发育期间说话时吐字不清，会影响到语言的发育。此外，由于自身外观上存在的缺陷，在进入学龄期后受到周围小伙伴的嘲笑，会让孩子形成自卑感，从而引起心理障碍。
而唇裂修复手术在小儿出生后3至6个月进行较好，因为此时小儿全身情况已趋于比较稳定，能较安全地手术，此时小儿口唇的发育状况也比较有利于手术。但是双侧兔唇手术宜在小儿6个月龄之后施行更稳妥些。都应争取在1岁之内进行兔唇裂修复手术。唇额裂修复手术根据每个患者情况不同有许多不同的手术方式，但无论何种术方式，随着患儿年龄的增长均可能发生发育畸形，需进行二次甚至对此修复才能达到“完美无缺”。总之，兔唇患者应尽早治疗，不但可以减少手术的危险性，术后留下的疤痕也越小。
专家提醒，父母双方的年龄越大，他们的孩子患先天性兔唇得几率就越大，为减小兔唇患儿的产生的机率，父母的育龄要适当的低一点。孕妇在怀孕期间不要抽烟、喝酒和用药，还要保持良好健康的心态，以免先天性患儿的产生。
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