1、防止反流屏障失常：食管下端括约肌由环状肌组成，通过神经肌肉作用保持一定张力，静息时有一定压力，使下端食管关闭，阻止胃内容物反流到食管。当此肌肉减少或功能缺陷时，则发生胃食管返流。
2、食管蠕动功能障碍：当食物进入食管时，食管出现向下的蠕动波将食物送入胃中，其功能障碍时，反流的胃内容物继续上溢。
3、食管及胃解剖异常：如食管裂孔疝。
4、激素的影响：前列腺素、高血糖素、胃抑制多肽可降低下端食管括约压力。
胃食管返流时由于酸性胃液反流，食管长期处于酸性环境中，可发生食管炎、食管溃疡、食管狭窄、反流物吸入气管可引起反复发作的支气管肺炎、肺不张，也可引起窒息、猝死综合征。
患儿常表现为呕吐，90%以上的患儿发生，生后一周即可出现。还可有体重不增、食管炎、食管靡烂或溃疡：表现不安、激惹、拒食，重者呕血或便血，导致缺铁性贫血。返流物吸入后可有吸入症状：肺部合并症，呛咳、窒息、呼吸暂停、吸入肺炎。并伴精神运动发育迟缓。
诊断可通过食管钡剂造影，如5分钟有3次以上反流可诊断。还可食管内窥镜检查及粘膜活检、食管ph测定、食管压力测定等。b超：检出阳性率90%，可见食管下端充盈。胃与食管间有液体来回流动。
治疗主要是体位治疗，轻者：食后1小时保持直立位；重者：30度倾斜的床上俯卧位，或50度角仰卧。饮食疗法：少量多餐，喂以稠厚乳汁。药物治疗：h2受体拮抗剂：抑制胃酸分泌。外科疗法：保守6周无效，有严重并发症、严重食管炎或缩窄形成。
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