感染性眼疾
如果感染发生于胚胎发育期，尤其是前三个月，会严重影响眼球的结构，造成重大眼球异常。感染原以梅毒、德国麻疹及艾滋病最常见，也最严重。生育年龄的妇女最好能事先加以预防治疗。小宝宝出生时，若产道有细菌，如淋菌、披衣菌，会使眼结膜感染而形成新生婴儿眼炎，因此新生婴儿应例行接受预防治疗，若已确定产道有感染，甚至可采取剖腹产，避免产道感染。
新生婴儿时期如果患有鼻泪管阻塞，泪囊容易反复发生泪囊炎、治疗方面要先控制感染，并以按摩或手术治疗先天性鼻泪管阻塞。原则上，六个月内采按摩的保守治疗，六个月以后则采取较积极之手术疗法。
遗传性眼疾
遗传形式，一般分为显性遗传、隐性遗传以及性连遗传三大类。常见的眼疾包括先天性白内障、无虹膜症、视网膜色素变性症等属显性遗传；视网膜胚胎母细胞瘤、部份视网膜色素变性症、白化症等，这些疾病属于隐性遗传；而色盲、脉络膜缺失症则属于性连遗传。
遗传性眼疾大多仅能控制症状，无法根治，因此婚前检查及遗传咨询是避免遗传性眼疾非常重要的步骤。