新生儿消化功能不完善，由于在胎内是母体供给营养，出生后需独立摄取、消化、吸收营养，消化道的负担明显加重，在一些病因的影响下很容易引起腹泻。
正常新生儿因、因为饮食的不同，大便型状及次数都可以有一些差异。若是牛奶喂养的，大便会偏干一点，每天1-2次;若吃母奶，每天大便可2-6次，性状较稀薄，但小儿吃奶及生长发育均正常，这不是腹泻，不需要治疗。
引起新生儿腹泻的原因很多，大致可有下列几种。
1.喂养不当
如果奶量加得过快，或突然改变饮食习惯，如牛奶改成代乳品，或在奶内加糖过多，或不能定时喂养等均会使消化道功能紊乱。
2.牛奶过敏
少数的新生儿对牛奶过敏，吃奶后引起变态反应，在进食牛奶不久发生荨麻疹，门腔勃膜水肿，呕吐及腹泻呈水样，严重的会脱水、休克,牛奶过敏还会引起肠猫膜出血，长期会引起营养不良和贫血。
3.肠道感染
新生儿的免疫功能还是很差，尤其是肠道的免疫力上面更低,当肠道遇到感染时,他是没有能力去减弱和中和这些细菌的毒力。此外，胎儿在子宫内无细菌的溢室环境中生长，生后立即在众多的细菌，病毒污染环境中生长，抵抗力很差，消化和其他各系统的调节功能都比较差，所以易患感染性腹泻。俗话说“病从口人”，尤其是人工喂养的新生儿若不注意奶头及奶瓶消毒，就可能被细菌污染引起腹泻。在产房、婴儿室及新生儿病房内，也可能因为消毒隔离不严格，发生新生儿流行性腹泻，多是沙门菌引起，严重的可致死亡。引起新生儿腹泻的病原还有致病性大肠杆菌、轮状病毒等。
4.肠列疾病
有些新生儿患了肺炎、败血症，病原菌分泌的毒素也可引起腹泻，若腹泻严重还会掩盖主要疾病，导致误诊。一些外科疾病也可引起腹泻，如大便灰白色，多见先天性胆道阻塞，大便果浆带血时，多见肠套叠。
5.新生儿腹泻的饮食和治疗
新生儿遇到腹泻的饮食和营养补充原则他是和大孩子的相似。在他刚开始有腹泻时就不能吃过多的奶水，如果母乳不足可添加稀释牛奶，水和牛奶的比例为1：1。不要操之过急，增加奶量过快。为减轻胃肠负担，适当地口服一些淡盐水、胃酶合剂、肠道益生菌制剂等，有益于帮助恢复消化功能。感染性腹泻可适当选择抗生素，种类和剂量应由医生决定。中药9香正气散、小儿泄泻停等对腹泻也很有效，副作用小。如果经治疗后大便次数仍多，应到医院诊治。
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